苗木免税证明应该向 当地税务局申请开具。具体步骤如下：
访问国家税务总局官方网站（https://www.chinatax.gov.cn/）。
点击“办税服务”选项。
选择“税务地图”，输入所在城市后即可查看税务局地址。
个体户若符合国家免税政策，无需开具免税证明，可直接享受免税待遇。
若需办理免税手续，应先到所在地国家税务局办理税务登记，然后可以申请购买发票。
根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第十六条第一款的规定，自种自育的绿化苗木和花卉免征增值税。
办理免税手续后，纳税人可以通过发票税控系统开具免税发票，并在发票的“增值税税率或征收率”栏选填“0”。
建议：
确认苗木免税政策的具体适用条件，确保符合相关免税规定。
提前联系当地税务局，获取详细的办理流程和所需材料，以确保顺利办理免税证明。